Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms