Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms