Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RGPD3A6NKT7 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms