Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
XIRP2A4UGR9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XIRP2A4UGR9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms