Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VWA8A3KMH1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms