Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms