Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF1Q9Y548 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms