Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HECTD4Q9Y4D8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HECTD4Q9Y4D8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HECTD4Q9Y4D8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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HECTD4Q9Y4D8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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HECTD4Q9Y4D8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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