Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms