Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPS5Q9UPZ3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms