Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHANK2Q9UPX8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms