Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX6Q9UNH7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX6Q9UNH7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms