Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms