Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB23Q9ULC3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB23Q9ULC3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB23Q9ULC3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB23Q9ULC3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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