Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms