Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms