Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms