Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE7Q9UBL6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE7Q9UBL6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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