Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms