Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CNTN3Q9P232 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN3Q9P232 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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