Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM30AQ9NV96 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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