Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms