Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPR88Q9GZN0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms