Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRIM8Q9BZR9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM8Q9BZR9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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