Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAPERQ9BY12 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms