Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF17Q9BXT8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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