Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms