Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BBS2Q9BXC9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms