Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2AFJQ9BTM1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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