Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms