Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP88Q99567 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms