Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 RAP1GAP2-203ENST00000540393 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PAX6-208ENST00000379132 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PRAC1Q96KF2 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AIPL1-203ENST00000381129 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PPM1K-209ENST00000514204 2962 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SIRT1-204ENST00000432464 3587 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNF423-205ENST00000562871 4514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ITGAX-203ENST00000562522 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM106A-201ENST00000392176 2281 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms