Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms