Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C18orf8Q96DM3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms