Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms