Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9XQ93008 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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