Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms