Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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