Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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