Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF248Q8NDW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF248Q8NDW4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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