Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms