Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN19Q8N6F1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CLDN19Q8N6F1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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