Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GALNT4Q8N4A0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GALNT4Q8N4A0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms