Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRINP3Q76B58 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms