Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms