Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms