Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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