Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBAP2Q5T6F2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms