Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms