Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A52Q3SY17 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms